Фамилия Шняукштас — редкий для русского уха пример литовской фамилии, которая сохранила свою исходную форму без русификации. В отличие от большинства фамилий на -с, -ас, -ис, которые в России часто получали окончание -ов или -ин (скажем, Шняукштас превратился бы в Шняукштасов), эта фамилия закрепилась в документах в оригинальном литовском виде. Такое могло произойти, если предки жили на территории Литвы, в приграничных районах Беларуси или Польши, где литовская антропонимика была привычна для местной администрации.

Основа фамилии — литовское слово šniaukštis или šniaukštas. В литовском языке это прозвище человека с неприятным, «шмыгающим» носом или того, кто постоянно хлюпает — глагол šniaukšti означает «шмыгать носом», «сопеть». Есть и другое значение: так могли назвать нелюдимого, ворчливого человека, который «сопит» в углу. Формант -as — типичное литовское окончание мужского рода именительного падежа. То есть Шняукштас — это буквально «Сопляк» или «Хлюпик», но в старом, бытовом, а не оскорбительном смысле.

По словообразовательной модели это типичная литовская фамилия, образованная от прозвища по поведению или физической особенности. В Литве такие фамилии встречаются нечасто, они скорее локальные, привязанные к конкретным деревням или хуторам. В России фамилия Шняукштас — большая редкость, и если она встречается, то почти наверняка у потомков литовских переселенцев конца XIX — начала XX века, когда многие литовцы уезжали в Сибирь, Прибалтику или центральные губернии в поисках работы.

В ономастических справочниках эта фамилия не описана — её нет ни в словаре Б. Унбегауна, ни в работах В. Никонова, что неудивительно: литовские фамилии в русской ономастике представлены скупо. Тем не менее, разбор прозвища даёт ясную картину: предок носителя фамилии получил её за манеру дышать или за характер — скорее всего, был неразговорчивым, себе на уме, или же просто имел привычку шмыгать носом в холодную погоду.