Фамилия Шныптев — редкая и неочевидная. Если отбросить суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Шныптя), в основе лежит прозвище Шныпть. В русском языке такого слова нет, искать его корни стоит в соседних языках, прежде всего в белорусском и украинском, где фамилии с похожей основой встречаются чаще.

Самая вероятная версия связывает прозвище Шныпть с глаголом «шныпаць» или «шнипати». В белорусских и западнорусских говорах «шныпаць» означает «щипать», «обрывать», а также «ходить мелкими шажками», «сновать туда-сюда». Прозвище Шныпть могли дать человеку суетливому, непоседливому, который постоянно «шныряет» по двору или делу. Вторая ветвь того же значения — «скупой», «прижимистый», то есть тот, кто «щиплет» каждую копейку. Оба варианта логичны для прозвищной модели: человека называли по заметной черте характера или поведения.

Менее вероятна, но допустима версия от диалектного слова «шнып» — «зажим», «клещи» или даже «крючок». В этом случае прозвище могло закрепиться за ремесленником, работавшим с мелкими деталями: слесарем, жестянщиком или портным, использующим зажимы. Однако поддержки в словарях эта гипотеза почти не находит, и основным остаётся «шныпаць» — щипать или сновать.

Географически фамилия Шныптев тяготеет к юго-западу России и востоку Беларуси. В современных базах она встречается единично, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от одного родового гнезда. Суффикс -ев, а не -ин, указывает, что основа прозвища оканчивалась на мягкий согласный (Шныпть), что типично для белорусского влияния.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шнып, Шныпко, Шныпарь) показывает, что Шныптев — самая поздняя и «обрусевшая» форма: первоначальное белорусское прозвище подогнали под великорусскую модель на -ев. По сословной принадлежности носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии от прозвищ по поведению редко встречались в дворянской среде.