Фамилия Шокбатаров — редкая, с ярко выраженным «нерусским» звучанием, и её происхождение почти наверняка лежит в тюркских языках. Если разложить фамилию на части, то основа — «Шокбатар» — распадается на два корня: «шок» и «батар». В казахском, киргизском и других тюркских языках «шок» (шөк) может означать «вершина», «пик», «остроконечный», а также «пучок», «хохолок» (например, на голове птицы). Слово «батар» — это вариант имени Батыр (Богатырь), которое в тюркской ономастике означает «герой», «силач», «воин». Таким образом, «Шокбатар» — это составное личное имя-прозвище, которое можно перевести как «Островерхий богатырь» или «Богатырь с хохолком». Вполне вероятно, что так называли человека с заметной причёской, шапкой или просто с острыми чертами лица, который обладал силой и отвагой.

Суффикс «-ов» стандартно указывает на русскую модель образования фамилий от имён и прозвищ. Когда в Российскую империю входили земли Средней Азии и Казахстана, местные имена часто русифицировали, добавляя окончание «-ов» или «-ев». Фамилия Шокбатаров — типичный пример такой адаптации: тюркское личное имя Шокбатар превратили в русскую фамилию по принципу «чей?» — «сын Шокбатара».

Географически фамилия тяготеет к южным регионам бывшего СССР: Казахстан, Киргизия, Узбекистан, а также Оренбургская и Астраханская области России, где исторически сильны тюркские общины. В центральной России она практически не встречается. Носители фамилии, скорее всего, потомки кочевников или оседлых тюркских народов, получивших фамилию в XIX — начале XX века при переписях или паспортизации.

Стоит отметить, что в некоторых тюркских языках «шок» имеет и другое значение — «удар», «толчок» (от арабского «шок» через персидский). В этом случае «Шокбатар» могло бы означать «Богатырь удара» или «Тот, кто бьёт как богатырь». Однако первая версия — с «вершиной» или «хохолком» — выглядит более органичной для традиционных прозвищ, которые часто описывают внешность, а не абстрактные качества. Фамилия уникальна тем, что сохранила в себе архаичную тюркскую конструкцию из двух полнозначных корней, что редкость даже для сложных фамилий этого региона.