Фамилия Шолтун — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычных русских суффиксов -ов или -ин, которые указывали бы на принадлежность отцу. Перед нами архаичная бессуффиксная модель, где фамилией стало само прозвище, без добавления патронимического окончания. Такие фамилии чаще встречались на юго-западе России, в Белоруссии и на Украине, где процесс формирования фамилий шёл иначе, чем в центральных и северных землях.

Сам корень «шолт» вызывает вопросы. Наиболее вероятная версия связывает его с диалектным словом «шолтун» — так в некоторых говорах называли непоседливого, суетливого человека, егозу. Сравните с однокоренными русскими «шолтать» (качать, болтать) или «шелтун» — тот же смысл неустойчивости, вертлявости. Прозвище могли дать человеку беспокойного нрава.

Вторая, менее очевидная гипотеза — связь с литовским или балтским корнем. На территории современных Смоленской, Брянской и Псковской областей, где исторически жили балтские племена, а позже селились литовцы, фамилии с основой «шолт» могли иметь иное происхождение. Например, литовское «šalti» означает «мерзнуть, стынуть», а «šaltis» — холод. В таком случае прозвище Шолтун мог получить зябкий или равнодушный, «холодный» человек. Но эта версия менее распространена и требует дополнительных доказательств для каждой конкретной семьи.

Что касается социального статуса, то, скорее всего, первые носители фамилии были крестьянами или посадскими людьми — фамилии без суффиксов в дворянской среде были редкостью. Географически фамилия Шолтун сегодня встречается единично, чаще всего на западе России и в сопредельных государствах. Носителям стоит обратить внимание на местные говоры и историю своей семьи — возможно, прозвище передавалось именно по той линии, где ценили живой, непоседливый характер.