Фамилия Шомухамедова — редкий пример фамилии, образованной от мужского имени, которое в русской традиции почти не встречается. Её основа — составное арабское имя Шомухамед, где первая часть «шо» — это фонетический вариант «шах» (персидское «царь, владыка»), а вторая — «Мухамед» (арабское «восхваляемый», имя пророка). В сумме имя Шомухамед означает «царь Мухамед» или «повелитель, подобный Мухамеду». Такая модель сложения имен (шах + имя пророка) характерна для тюрко-персидского культурного ареала, особенно среди узбеков, таджиков и туркмен.

Фамилия Шомухамедова — женская форма; мужская — Шомухамедов. Она образована по русскому патронимическому суффиксу -ов, который в XIX–XX веках массово присоединяли к восточным именам при русификации фамилий на территории Средней Азии. В отличие от исконно русских фамилий, где суффикс -ов указывает на принадлежность отцу («чей сын?»), здесь он просто фиксирует имя предка как родовое прозвище.

Носители фамилии сосредоточены в Узбекистане, Туркменистане и Таджикистане, а также среди диаспор в России. В дореволюционных метриках эта фамилия почти не встречается: её массовое появление связано с советским паспортным учётом 1920–1930-х годов, когда людям без фамилий давали их по имени отца или деда. Поэтому предки Шомухамедовой, скорее всего, не принадлежали к знати или духовенству — имя Шомухамед мог носить обычный крестьянин или ремесленник, а фамилию его потомки получили уже в XX веке.

Словообразовательный нюанс: ударение в фамилии почти всегда падает на предпоследний слог — Шомуха́медова, хотя в исходном имени ударение может смещаться (Шомухаме́д). На письме встречается вариант Шамухамедова, что отражает диалектное произношение, где «о» переходит в «а» под влиянием местных говоров. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шомухамедов отличается от более частых Мухамедов или Мухаммадов именно приставкой «шо-», которая сразу указывает на регион происхождения — юг Средней Азии.