Фамилия Шонус — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Самая вероятная версия связывает её с литовским или жемайтийским корнем. В литовском языке есть слово šonas — «бок», «сторона», а также šoninis — «боковой». Прозвище Шонас или Шонус могли дать человеку по характерной черте: например, тому, кто ходил боком, косил при ходьбе, или же тому, кто жил на отшибе, «сбоку» от основной деревни. Литовский суффикс -ус (-us) — типичный для мужских прозвищ и фамилий в западной Литве и бывшей Виленской губернии. Таким образом, Шонус — это фамилия, застывшая в форме старого прозвища, без русского суффикса -ов или -ин, что прямо указывает на её балтское происхождение.

Вторая, менее убедительная гипотеза — связь с польским szon, заимствованным из немецкого Schon. Однако это слово означает «уже» или «красивый» (в диалектах), и прозвище с таким значением маловероятно. Версия с литовским šonas выглядит надёжнее, потому что фамилия географически тяготеет к северо-западным регионам бывшей Российской империи — современным Литве, Беларуси и приграничным областям Польши. Встречаемость фамилии в России крайне низкая, что подтверждает её локальный, региональный характер.

Словообразовательная модель проста: корень Шон- плюс окончание -ус. Никаких русских патронимических суффиксов нет, поэтому фамилия не могла возникнуть в центральной или северной России. Она принадлежит к пласту балтских фамилий, которые принесли в русскую культуру через миграции крестьян и мещан в XIX веке. В метрических книгах того времени фамилию могли записать и как Шонас, и как Шонус — в зависимости от говора писаря.

Искать в этой фамилии дворянские корни или связь с известными историческими родами не стоит. Шонус — фамилия крестьянская или мещанская, скорее всего, из числа тех, что закрепились за одной семьёй в небольшой деревне. Без дополнительных генеалогических изысканий точную географию указать трудно, но если у вас есть семейное предание о предках из-под Вильнюса или Каунаса, эта версия становится почти доказанной.