Фамилия Шошкина — женская форма фамилии Шошкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Шошка. В основе, скорее всего, лежит диалектное слово «шошка», которое в разных говорах имело несколько значений. Наиболее вероятная версия отсылает к глаголу «шушукать» или «шошкать» — шептать, говорить тихо, невнятно. В таком случае Шошкой могли прозвать неразговорчивого, застенчивого человека или, наоборот, того, кто любил пошептаться, посудачить. Менее распространённая, но тоже возможная гипотеза связывает фамилию с названием птицы — в некоторых областях «шошкой» называли сороку или сойку, и прозвище могло закрепиться за болтливым или пёстро одетым человеком.

Модель образования фамилии типична для русского севера и центральных регионов: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду. Шошкин буквально означает «сын Шошки» или «из семьи Шошки». Это так называемая «полуотчество», когда фамилия образована не от полного крестильного имени, а от бытового прозвища, которое со временем заменило имя в повседневной жизни.

Интересно, что фамилия Шошкин (и Шошкина) — довольно редкая. Она не встречается в крупных исторических справочниках дворянских родов, что говорит о её простонародном, крестьянском или мещанском происхождении. Встречается преимущественно в центральной России и Поволжье, особенно в бывших Нижегородской и Костромской губерниях, где диалектное слово «шошка» было в ходу. Ударение в фамилии, как правило, падает на первый слог: Шо́шкина.