Фамилия Шпакштейн — редкий пример сращения славянской основы с немецким суффиксом. Корень здесь — «шпак», что по-украински, белорусски и в южнорусских говорах означает «скворец». Прозвище Шпак могли дать человеку за голос, внешность или манеру поведения, напоминающую эту птицу. Вторая часть — «-штейн» (от немецкого Stein — «камень») — типичный компонент ашкеназских фамилий, который часто добавляли к основе, чтобы придать ей «благородное» звучание на немецкий манер. Таким образом, перед нами гибридная фамилия: восточнославянское прозвище, оформленное еврейским фамильным суффиксом.

Словообразовательная модель проста: к основе Шпак прикрепили немецкий суффикс -штейн. Такие фамилии массово возникали на территории Российской империи (в основном в черте оседлости — на Украине, в Белоруссии, в Польше) в конце XVIII–XIX веков, когда еврейскому населению предписали иметь постоянные фамилии. Местные чиновники или сами носители нередко комбинировали местные прозвища с немецкими элементами, популярными в австрийской и прусской бюрократии.

У фамилии нет единого дворянского корня. Она не относится к старым русским боярским или казачьим родам. В сословном отношении предки Шпакштейнов — скорее всего, мещане, ремесленники или торговцы из местечек, где украинское и еврейское население жило рядом. Встречаются варианты написания: Шпакштайн, Шпакстин, но основная форма закрепилась через немецкое произношение.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Шпак, Шпаков, Шпакин — это чистые славянские варианты без «камня». Шпакштейн стоит в одном ряду с такими гибридами, как Шпакберг, Шпакман, где немецкий суффикс меняет социальный оттенок фамилии, но не её смысловое ядро. В современной России фамилия встречается редко, в основном в западных регионах и крупных городах.