Фамилия Штуганова — женская форма фамилии Штуганов, и её происхождение стоит искать в прозвище или профессии предка. Основа «штуган» — слово, которое в русских говорах, особенно на Урале и в Сибири, имело два значения. Первое — это «штукарь», то есть хитрец, пройдоха или человек, любящий придумывать необычные вещи (от «штука» в смысле выходка, проделка). Второе, более редкое — так могли называть мастера, изготавливающего штучный товар, то есть работающего не на потоке, а по индивидуальным заказам (ср. «штучная работа»). В некоторых диалектах «штуган» — это ещё и недотёпа, растяпа, но это значение встречается реже.

Суффикс «-ов» в фамилии указывает на принадлежность: Штуганов — буквально «сын Штугана». Модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, и уводит нас в XVI–XVII века, когда такие именования закреплялись за крестьянами и посадскими людьми. Географически фамилия Штугановых чаще встречается в Пермском крае и Кировской области — именно там диалектное слово «штуган» фиксируется в местных говорах. Это подтверждает, что предок-носитель прозвища жил в северном или приуральском регионе, где слово сохранило бытовой смысл.

Если отталкиваться от значения «штукарь», то первый Штуганов мог быть человеком с характером — изобретательным, склонным к розыгрышам или нестандартным решениям. Если же от «штучного мастера», то предок был ремесленником, ценившимся за качество, а не за количество. Спор между этими версиями невелик: обе правдоподобны, но первая (прозвище по характеру) типичнее для русской ономастики, где фамилии от черт личности встречаются чаще, чем от узких профессий.

В написании фамилии нет сложных буквосочетаний, но ударение обычно падает на второй слог: Штуга́нов. Редкость фамилии (в современных базах данных её носителей немного) говорит о том, что прозвище не стало массовым и сохранилось в локальных линиях. Сравните с однокоренными: Штукин, Штукарев — у них та же основа, но разные суффиксы, указывающие на иные варианты прозвища. Штуганов — более архаичная форма, с диалектным оттенком, что делает её интересной для тех, кто ищет корни в северных или уральских деревнях.