Фамилия Штуопинис — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка связано не с русской, а с литовской языковой средой. В русском языке нет корня «штуоп-», и словообразовательная модель с окончанием -ис характерна для литовских фамилий мужского рода в именительном падеже. Скорее всего, перед нами литовская фамилия Štuopis или Štuopinis, русифицированная в написании и склонении.

Основа фамилии восходит к литовскому слову štuopas или диалектному štuopis. В литовском языке это может означать «столб», «кол», «тычина» — то есть длинный и прямой предмет. В переносном смысле такое прозвище могли дать высокому, худощавому человеку с прямой осанкой. Встречается и другая версия: в некоторых говорах štuopas — это «чурбан» или «пенёк», что могло указывать на медлительность или упрямство носителя.

Фамилия образована по продуктивной для литовского языка модели: основа + суффикс -inis (русская передача -инис). Суффикс -inis в литовских фамилиях часто указывает на принадлежность или характерный признак: буквально «относящийся к столбу» или «столбовый». Со временем, при попадании в русскоязычную среду, фамилия потеряла литовское ударение и стала восприниматься как экзотическая, но не меняющаяся по падежам по правилам литовского языка.

В дореволюционных метрических книгах западных губерний Российской империи (Ковенской, Виленской, Сувалкской) можно встретить варианты Штупис, Штупянис и Штуопинис. Переселенцы с этими фамилиями могли оказаться в Сибири или на Дальнем Востоке в ходе столыпинской аграрной реформы или после Первой мировой войны. Социально предки носителя фамилии — скорее всего, крестьяне-литовцы, не принадлежавшие к шляхте, так как фамилии на -inis у литовских крестьян стали массово фиксироваться в XIX веке после отмены крепостного права.

Сведений о массовой распространённости или знаменитых носителях фамилии Штуопинис в открытых источниках нет. Это редкая фамилия, которая не встречается за пределами нескольких семей, сохранивших литовские корни в русском языковом окружении.