Фамилия Шубинок — редкий случай, когда географическая привязка важнее разбора корня. Если бы фамилия оканчивалась на -ов или -ин, её без колебаний связали бы с прозвищем или именем Шуба, Шубка. Но суффикс -ок, а точнее форма Шубин-ок, выдаёт иной механизм образования.

Скорее всего, перед нами не прямая производная от «шубы», а фамилия, возникшая на западных или юго-западных русских землях, где были распространены уменьшительные и патронимические формы на -ок. В белорусской и украинской ономастике суффикс -ок мог означать «сын такого-то» или «маленький, младший». Шубинок — это буквально «сын Шубина» или «маленький Шубин». То есть основой послужила уже готовая фамилия Шубин, а Шубинок — её ответвление, указывающее на принадлежность к младшей ветви рода или на конкретного потомка.

Сам корень «шуб-» восходит к прозвищу Шуба. В Древней Руси шуба была дорогой, статусной одеждой, поэтому прозвище могли дать либо зажиточному человеку, который ходил в шубе, либо, наоборот, скорняку или торговцу мехами. В словаре Б. Унбегауна фамилия Шубин относится к группе фамилий, образованных от названий одежды, и считается достаточно древней. Шубинок, в свою очередь, могла появиться, когда крестьянам или мещанам в XIX веке давали фамилии по отцу или деду, используя местные суффиксы. Встречается такая модель в основном на территории современной Беларуси, в Смоленской и Брянской областях, реже — на Украине.

Версия о прямом прозвище «Шубинок» (человек, похожий на шубу, или носивший маленькую шубу) менее вероятна: суффикс -ок в русских прозвищах встречается, но обычно в более простых формах вроде Шубок. Форма Шубинок явно вторична, что и подтверждает её патронимический характер. Таким образом, предок носителя этой фамилии был, скорее всего, сыном или внуком человека по фамилии Шубин, а тот, в свою очередь, получил прозвище от шубы — либо как владелец, либо как мастер.