Фамилия Шудогубов — редкий случай, где прозвище, лёгшее в основу, заставляет задуматься не столько о происхождении корня, сколько о том, как именно это слово звучало в живой речи. Разберём её по частям. Основа «шудо-» не имеет очевидного значения в современном русском литературном языке. Самое правдоподобное объяснение — перед нами вариант, возникший из-за диалектного произношения или аканья. В южнорусских и некоторых среднерусских говорах слово «шудо» могло быть формой слова «чудо» (с характерным «шоканьем» — произношением «ш» вместо «ч»). Тогда Шудогуб — это «чудогуб», то есть человек с необычными, «чудными» губами. Прозвище могли дать за какую-то особенность рта: толстую губу, заячью губу, привычку кривить рот или даже за манеру говорить.

Вторая часть — «губ» — прозрачна и указывает на часть лица. Модель образования фамилии проста: суффикс -ов присоединился к прозвищу Шудогуб, означая «сын Шудогуба» или «принадлежащий Шудогубу». Это типичная русская патронимическая модель, распространённая в XVI–XVII веках среди всех сословий, но особенно среди крестьян и служилых людей.

Менее вероятная, но допускаемая версия — связь с диалектным глаголом «шудить» (проказничать, чудить) или существительным «шуд» (в некоторых говорах — бес, чёрт). Тогда прозвище могло означать «чертовски губный» или «проказник с губами», но это натяжка. Первая версия с «чудом» выглядит надёжнее, так как опирается на живую фонетику русских говоров.

Географически фамилия тяготеет к югу России, к областям, где «чоканье» и «шоканье» были нормой: Рязанская, Тамбовская, Воронежская, Курская губернии. Встречаются единичные носители и в других регионах, но это, скорее, следствие миграций. Сословно предки Шудогубовых — почти наверняка крестьяне или однодворцы. В дворянских родословных книгах эта фамилия не отмечена.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Чудогубое, Чудогубов — показывает, что вариант с «ш» сохранился именно в тех семьях, где диалектное произношение закрепилось в документах. Если бы писарь записал прозвище «правильно», мы бы сейчас имели фамилию Чудогубов. Но история распорядилась иначе, и Шудогубов — живое свидетельство того, как звучала речь на русской окраине несколько веков назад.