Фамилия Шынтемирова — редкий случай, когда основа не славянская, а тюркская, и разбор начинается не с корня, а с суффикса. Женская форма на -а указывает, что мужской вариант — Шынтемиров, а сама фамилия образована по русской модели притяжательных прилагательных: к основе добавили суффикс -ов (в мужском роде) и окончание -а (в женском). Такое оформление типично для фамилий, которые возникли в среде, где русское делопроизводство фиксировало тюркские имена и прозвища, — чаще всего на Урале, в Поволжье или в Сибири, среди башкир, татар, казахов или ногайцев.

Основа «Шынтемир» — составное тюркское имя или прозвище. Первая часть, «шын» (сын, шын), в тюркских языках означает «истинный, настоящий, верный». Вторая часть, «темир» (тимер, темир), — «железо». В сумме получается «истинное железо» или «настоящий железный». Такие двухосновные имена были распространены у кочевых народов: они не просто называли человека, а давали ему характеристику — крепкий, надёжный, несгибаемый. Сравните с фамилиями Темиров, Темирханов, Бектемиров — все они восходят к тому же «темир» и несут оттенок силы.

Споров о происхождении почти нет: тюркская основа очевидна, а русский суффикс — результат канцелярской записи. Единственный вопрос — к какому именно народу относился первый носитель. Судя по фонетике (звук «ш» в начале, а не «с» или «ч»), это скорее южноуральский или сибирский ареал, где башкирский или казахский языки дают «шын», а не, скажем, татарское «чын» или «сын». Впрочем, в татарской среде тоже встречается вариант Шынтемиров, но реже.

Социальный контекст простой: фамилия недворянская. В России тюркские имена с русскими суффиксами обычно получали служилые люди «по прибору» (казаки, стрельцы), крестьяне или торговцы, которые переходили в православие или просто попадали в русские переписные книги. Никаких графских родов Шынтемировых не было — это фамилия, которая говорит о происхождении из степной или лесостепной полосы, где люди ценили качества, заложенные в имени: верность и твёрдость.

В современных базах данных фамилия встречается редко, в основном в Челябинской, Оренбургской областях и в Башкортостане. Носители, скорее всего, потомки башкир или казахов, фамилия которых закрепилась в документах XIX века.