Фамилия Шыныбаев образована от имени Шыныбай, которое вероятнее всего является вариантом казахского мужского имени Шинбай, состоящего из двух основ. Первая из них – «шин» - в переводе с казахского означает «высота, вершина». Второй элемент – «бай» - переводится на русский язык как «богач, богатый, зажиточный человек». Соответственно, именование Шыныбай можно перевести на русский как «высокий Бай», «хозяин вершин» и т. Таким образом, потомок человека, которого звали Шыныбай, со временем получил фамилию Шыныбаев. Так, документах начала XX века упоминается Шыныбаев Бимагамбет, родившийся в 1985 году в Семипалатинской области.