Фамилия Сичушен — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычных русских суффиксов вроде -ов или -ин, что сразу наводит на мысль о нерусских корнях. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая на юге России или Украине, где были распространены модели на -енко, -ук, -юк, а также их усечённые или изменённые формы. Суффикс -ен в фамилии Сичушен может быть остатком украинского -енко, который со временем «потерял» окончание -ко, что иногда случалось при русификации или при записи фамилий в документах. Например, из Сичушенко мог получиться Сичушен.

Основа фамилии — «Сич-». Она отсылает к слову «січ» (укр. «сечь»), то есть к Запорожской Сечи — военно-административному центру запорожских казаков. Прозвищем Сич, Сичовый или Сичушен могли наградить человека, имевшего отношение к казачеству: либо запорожца, либо выходца из сечевой территории. В украинском языке «січ» означает ещё и «рубка», «вырубка», так что прозвище могло относиться к лесорубу или человеку с резким, «рубящим» характером. Уменьшительно-ласкательный суффикс -уш- (-уша) в основе указывает на то, что прозвище давали молодому или младшему по возрасту человеку — «маленький сечевик» или «сын того, кого звали Сич».

Географически фамилия Сичушен, по доступным данным, встречается в основном в южных регионах России (Краснодарский край, Ростовская область) и на востоке Украины. Это подтверждает версию о казачьем или крестьянском происхождении, без связи с дворянскими родами. Сословно предки носителя фамилии, скорее всего, были казаками или государственными крестьянами, а сама фамилия закрепилась как указание на место жительства или род занятий — «тот, кто из Сечи» или «сын сечевика».

Другие возможные, но менее вероятные версии: связь с диалектным словом «сич» (мелкий сор, мусор) или с тюркским именем Сич (встречается у ногайцев), но украинско-казачья трактовка выглядит убедительнее из-за суффикса и ареала распространения.