Фамилия Сидоченко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала самой продуктивной на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко изначально означал «маленький» или «сын»: Сидоченко — буквально «маленький Сидор» или «сын Сидора». Основа здесь — каноническое мужское имя Сидор (от греческого Исидорос, «дар Изиды»), которое в народной среде давали детям в честь святого Исидора.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые преобладали в великорусских землях, украинские фамилии на -енко часто фиксировали не отчество, а прозвище или указание на родство по мужской линии. Сидоченко могло закрепиться за внуком или правнуком Сидора, когда прямое отчество уже не использовалось. В письменных источниках XVIII — начала XIX века такие фамилии встречаются в реестрах казацких полков, мещанских списках и метрических книгах Черниговской, Полтавской, Харьковской губерний.

Интересная деталь: в отличие от более частотной формы Сидоренко, вариант Сидоченко — результат ассимиляции звуков в живой речи. В украинских говорах сочетание «др» иногда упрощалось до «дч» (сравните: «сидр» → «сидч»). Поэтому Сидоченко — не отдельная ветвь, а фонетический «след» произношения конкретной местности, скорее всего, южных или центральных районов Украины. Это делает фамилию ценной для диалектологов: по ней можно судить о том, как говорили в той или иной слободе или хуторе.

Встречаются и спорные версии. Некоторые исследователи допускают, что основа могла быть не от имени, а от прозвища Сидок — человека, который постоянно сидит (сидит без дела или, наоборот, сиднем сидит на одном месте). Однако эта гипотеза слабая: прозвище Сидок не зафиксировано в источниках XVII–XVIII веков как самостоятельное, а имя Сидор было чрезвычайно распространено. Поэтому основная версия — патронимическая, от имени Сидор.

Сословно носители фамилии Сидоченко в основном принадлежали к казачеству и крестьянству. В документах XIX века встречаются как рядовые казаки, так и мещане. Дворянских родов с такой фамилией не отмечено — суффикс -енко в целом редко встречается в гербовниках, поскольку дворянство на украинских землях чаще брало фамилии на -ский/-цкий.