Фамилия Сирсниня — редкий случай, когда в основе, скорее всего, лежит не русское, а прибалтийское слово. Судя по окончанию, это латышская или литовская фамилия в женском роде. В латышском языке суффикс -niece или окончание -niece указывает на принадлежность к чему-либо или происхождение откуда-то (например, Rīdziniece — жительница Риги). Мужской вариант звучал бы как Сирснис.

Корень «сирс» (sirsis) по-латышски означает «шершень». Таким образом, Сирсниня — это «шершнёва», «относящаяся к шершню» или «дочь/жена Шершня». Прозвище Сирснис мог получить человек с неспокойным, сварливым характером или, наоборот, тот, кто был так же заметен и опасен, как это крупное насекомое. В крестьянской среде Латвии и Литвы такие «насекомые» прозвища были обычны: они метко характеризовали внешность или нрав человека.

Написание «Сирсниня» с двумя «н» — особенность русской или украинской передачи латышской фамилии. В оригинале она писалась бы как Sirsiniece или Sirsniņa (с мягким знаком в конце). Встречаемость фамилии крайне низкая, искать её стоит в исторических областях Латгалии или Земгале, где латышские фамилии на -niece были особенно распространены. В России такая фамилия могла появиться в результате переселения латышей в Сибирь или на Дальний Восток в конце XIX — начале XX века.

Версия о славянском происхождении (от слова «сирый» — сирота или «сирень») маловероятна: ни один славянский суффикс не даёт окончания «ня», а для фамилий от «сирени» было бы естественно окончание -ев (Сиренева) или -ский (Сиренский). Поэтому прибалтийский след — основной и самый правдоподобный.