Фамилия Сискадрот — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает со звучанием, но корень ставит в тупик. В русской ономастике нет ни одного словарного слова, от которого можно было бы её уверенно произвести. Если отбросить версию случайной описки или искусственного происхождения (что для фамилий, передававшихся устно, маловероятно), остаётся искать в географических названиях или заимствованиях.

Самый правдоподобный путь — топонимический. Сискадрот может быть искажением названия реки, села или региона, где жили первые носители. На слух ближе всего варианты из романских языков: например, французское Siscadrot или итальянское Siscadrotti. В Италии есть местечко Сиска (Sisca) в регионе Фриули-Венеция-Джулия, а суффикс -drot/-otto указывает на уменьшительную или прозвищную форму. В таком случае предок мог быть выходцем из этих мест, а фамилию ему дали по названию родного хутора или по прозвищу «маленький сиска» (возможно, от диалектного названия растения или сухой земли).

Вторая версия — искусственное образование в среде духовенства. В семинариях XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали фамилии, составленные из латинских или греческих корней. «Сискадрот» могло возникнуть как нарочито сложная конструкция: лат. siccus («сухой») + греч. drosos («роса») — «сухая роса» или «иссушенная влага». Это типичная семинарская игра слов, но звучит она слишком необычно даже для той эпохи.

Третья, наименее вероятная, но не исключённая гипотеза — связь с апеллятивом «сискарь» (диалектное название мелкой рыбы в некоторых северных говорах) или «сиск» (устаревшее «свист»). Тогда Сискадрот могло быть патронимическим прозвищем рыбака или свистуна с необычным суффиксом -дрот, который нехарактерен для русских фамилий. Однако ни один из этих корней не даёт убедительного объяснения финальной части.

Фамилия Сискадрот не встречается в массовых списках дворянства, купечества или крестьянства центральных губерний. Это имя единичное, почти уникальное. Его носители, скорее всего, происходят из небольшой локальной группы — либо из западных окраин Российской империи с иноязычным населением, либо из семей, где фамилию записали со слов приезжего и закрепили в таком виде. Точную этимологию без генеалогического поиска по конкретному региону установить невозможно.