Фамилия Сисоэва — женская форма, а её мужской вариант Сисоэв. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная русская фамилия с суффиксом -ев, но её основа вызывает вопросы. В русском языке нет распространённого имени или слова «Сисой», которое легко ложилось бы в эту модель. Однако есть имя Сисой — редкая, но исторически засвидетельствованная форма канонического имени Сисой (от древнегреческого «Сисой», предположительно египетского происхождения, означающего «принадлежащий богине Исиде» или просто «египтянин»). В православных святцах это имя носил преподобный Сисой Великий, живший в V веке. Таким образом, Сисоэв — это отчество от имени Сисой: «чей?» — Сисоев, то есть сын Сисоя. Вариант написания через «э» (Сисоэв вместо Сисоев) — редкий, но возможный. Он мог возникнуть из-за диалектного произношения (в некоторых говорах «ё» звучало как «э») или просто из-за ошибки писаря при записи фамилии в документах. Встречается и написание Сисоев, что более логично с точки зрения русской орфографии.

Интересно, что фамилия Сисоэва почти не встречается в центральных регионах России. Основные очаги её бытования — южные области (Ростовская, Краснодарский край) и Поволжье. Это наводит на мысль, что носители фамилии могли быть выходцами из казачьих или крестьянских семей, где имя Сисой (хоть и редкое) иногда давали по святцам. Поскольку имя не было популярным, фамилия осталась малочисленной и не разошлась широко. В отличие от фамилий на -ин или -ов, которые образуются от тысяч имён, Сисоэв/Сисоэва стоит особняком — её носители, скорее всего, потомки одного или нескольких родов, где имя Сисой передавалось из поколения в поколение либо было дано предку в честь святого. Социальный статус предков, судя по географии, — крестьяне или мещане, без дворянских корней, так как фамилия не попала в родословные книги.

Если сравнивать с однокоренными, то в русских говорах есть слово «сисой» (диалектное, иногда как прозвище для человека с большими глазами или неуклюжего), но эта версия менее вероятна: прозвища редко давали по имени святого, а здесь прямое совпадение с церковным именем. Так что основная и единственная правдоподобная версия — патроним от имени Сисой. Фамилия Сисоэва — живое напоминание о редком христианском имени, которое почти исчезло из обихода, но сохранилось в документах и метриках.