Фамилия Сивхонов — редкий пример, где географический акцент в суффиксе спорит с прозрачной основой. Разберёмся по порядку.

Основа «Сивхон» почти наверняка восходит к прилагательному «сивый», то есть седой, пепельно-серый. В русских говорах «сивый» часто относилось к масти животного (сивый конь) или к цвету волос человека. Но напрямую от «Сивко» или «Сивка» фамилия не образована — здесь вмешался суффикс -он, который в севернорусских и сибирских фамилиях нередко заменял более привычный -ов или -ин. Сравните: Сивков и Сивконов — разница в том, что вторая форма как бы «законсервировала» древнее прозвище Сивхон, где -х- могло быть либо остатком старого суффикса (как в «петух»), либо диалектным наращением.

Самая вероятная версия: прозвище Сивхон дали человеку с седыми волосами или, что встречается реже, хозяину сивой лошади. В русских говорах слово «сивко» было распространённой кличкой коня, но форма «сивхон» — более редкая, она могла бытовать в северных областях (Архангельская, Вологодская губернии) или в Сибири, куда переселенцы приносили свои диалекты. Суффикс -он в фамилиях (вроде Кузьминых — Кузьмин) часто указывает на принадлежность к роду, но здесь он встроен в основу, что делает фамилию похожей на патроним второго порядка: «сын Сивхона», где Сивхон — уменьшительное от Сивый.

Если искать альтернативу, можно предположить тюркское происхождение: «сив» в некоторых тюркских языках означает «вода», а «хон» — «хан», но это натяжка. Во-первых, для тюркских фамилий характерны другие суффиксы, во-вторых, сочетание «сивхон» не встречается в известных ономастиконах тюркских народов. Поэтому славянская версия с «сивым» остаётся основной.

Учитывая редкость фамилии, её носители, скорее всего, происходят из одной локальной группы — потомков человека по прозвищу Сивхон, который жил в северной или сибирской деревне. В дореволюционных списках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем закреплении или малом числе дворов.