Фамилия Скирточенко — яркий пример украинской модели фамилии на -енко, которая означает «маленький» или «потомок». В данном случае — потомок человека по прозвищу Скирточа, Скиртак или Скиртко. Эта модель характерна для Левобережной и Степной Украины, где фамилии на -енко массово закрепились в XVII–XVIII веках.

Основа фамилии — «скирт-» — восходит к слову «скирта»: большая копна сена или соломы, уложенная особым образом для хранения. Прозвище Скирта могли дать человеку, который складывал скирды, либо крестьянину, чья внешность или осанка напоминали эту высокую плотную копну. Форма «Скирточенко» предполагает промежуточную ступень: от «Скирта» через уменьшительное «Скиртко» или «Скирточа» (с суффиксом -оч-) к фамилии сына — «Скирточенко».

Географически фамилия тяготеет к Полтавщине, Сумщине и Харьковщине — регионам, где традиционно занимались выращиванием зерновых и заготовкой сена. Там же распространены однокоренные «Скирта», «Скиртко», «Скиртов». Важная деталь: в русских говорах слово «скирда» женского рода, а в украинских — мужского («скирт»), что и дало форму прозвища. Таким образом, Скирточенко — не просто «сын скирдовщика», а человек, чей предок был тесно связан с крестьянским трудом, скорее всего, с уборкой урожая.

Сословно фамилия почти наверняка принадлежала крестьянам или казакам. В реестрах Войска Запорожского встречаются фамилии с таким корнем, но без конкретных дат и имён говорить о точной генеалогии сложно. Спорных версий у фамилии нет: корень прозрачный, суффикс типичный, иных значений слово «скирточа» не имеет.