Фамилия Скитченко почти наверняка произошла от прозвища Скитка, которое в разных говорах имело два разных смысла. Разобраться, какой из них верен для конкретной семьи, уже невозможно, но обе версии по-своему интересны.

Первая версия ведет к украинскому слову «скитки» — «блуждания». Тогда Скиткой называли человека, который любил ходить пешком, много путешествовал, вел подвижный образ жизни. В некоторых говорах это слово имело и более резкий оттенок — так могли сказать о бродяге. Вторая версия связана со «скитом» — уединенным жилищем монахов-отшельников или старообрядческим поселением в глухой местности. В этом случае прозвище могло закрепиться либо за человеком, принадлежавшим к скиту, либо за тем, кто любил уединение и тишину.

Модель образования фамилии простая и характерная для украинской традиции: к основе Скитк- добавили патронимический суффикс -енко, который изначально означал «сын кого-то», то есть «сын Скитки». Такие фамилии массово закреплялись на Левобережной Украине с XVI–XVII веков, и Скитченко — типичный представитель этой волны. Показательно, что в русском языке аналогом этой модели стали бы фамилии Скиткин или Скитов, но украинский суффикс сохранил исходную форму.

Само прозвище Скитка — это уменьшительная форма, которая в роли личного именования могла использоваться и как самостоятельное имя, и как насмешливое или ласковое прозвище. Со временем оно вытеснило крестильное имя предка и легло в основу фамилии, которая передавалась уже по наследству.

Стоит добавить, что фамилия редкая и почти не встречается за пределами украинского и южнорусского ареала. Это говорит о том, что род, скорее всего, имел локальное происхождение и не расселялся широко. Встречаются и более редкие варианты написания — Скитченко, Скитченков, но основная форма сохранила украинское звучание.