Фамилия Скомаха — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию без каких-либо суффиксов, в чистом виде. В большинстве русских фамилий работают модели на -ов, -ин, -ский, а здесь мы видим так называемую «нулевую» суффиксацию: слово Скомаха стало фамилией как есть, без добавления родового окончания. Такое оформление характерно для украинской и южнорусской традиции, а также для прозвищ, которые закрепились за одним человеком и не требовали уточнения «чей сын».

Само слово «скомаха» в древнерусских говорах означало скомороха — бродячего музыканта, плясуна, шута. Форма без «р» (скомаха вместо скоморох) — результат упрощения или диалектного произношения, которое встречается в южных и западных регионах Руси. Первые письменные фиксации слова «скомрах» относятся к XI веку, а в Новгородской летописи упоминаются скоморохи уже в XII веке. Таким образом, предок носителя фамилии Скомаха почти наверняка был скоморохом — либо по ремеслу, либо получил такое прозвище за весёлый нрав, любовь к пению и пляскам.

Стоит отметить, что скоморохи на Руси были не просто развлекателями. В допетровскую эпоху они нередко выступали носителями народной сатиры, высмеивали бояр и церковников, за что их преследовали. В XVII веке царь Алексей Михайлович даже издал указ о запрете скоморошества и уничтожении их музыкальных инструментов. Поэтому прозвище Скомаха могло быть не только профессиональным, но и нарицательным — так называли человека, который слишком громко смеялся, балагурил или нарушал тишину.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Скоморохов, Скоморошко, Скоморохин — показывает, что Скомаха стоит особняком. Если Скоморохов — это типичная русская фамилия на -ов (чей? — скоморохов сын), то Скомаха сохранила исходное прозвище в почти неизменном виде. Это говорит о том, что фамилия могла закрепиться в среде, где не было строгой патронимической системы, например, среди казачества или вольных крестьян южных земель. Географически фамилия встречается в основном на Украине, в Белгородской и Воронежской областях — то есть в зоне украинско-русского пограничья, где диалектные формы вроде «скомаха» как раз и бытовали.

Версия о связи с тюркским «скомах» (как вариант — «сокмак» — бить, колотить) выглядит натянутой и не подтверждается ни бытованием такого слова в тюркских языках, ни историей фамилии. Правдоподобнее всего — именно скомороший след, тем более что в русских говорах до XIX века фиксировались формы «скомаха», «скомарох» наряду с литературным «скоморох».