Фамилия Скорытченко образована по типичной для украинского и южнорусского ономастикона модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в XVI–XVIII веках был основным патронимическим показателем на землях современной Украины: он означал «сын» или «потомок», а позже закрепился как фамильный. В основе фамилии лежит прозвище Скорытка.

Само прозвище Скорытка — скорее всего, производное от глагола «скорытать» (или «скоротать»). В диалектах «скоротать» значит «провести, протянуть время», «кое-как прожить», а также «сократить, сделать короче». Человек, которого прозвали Скорыткой, мог быть тем, кто «коротко» говорит, либо тем, кто умеет скоротать долгий путь или вечер рассказом и шуткой. Реже встречается версия, что корень связан со словом «скорый» — быстрый, торопливый, но это менее вероятно: суффикс -ыт- в прозвищах чаще указывает на действие, а не на качество.

Фамилия Скорытченко — патроним: буквально «сын Скорытки». Встречается она преимущественно в восточных и южных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в Поволжье. Редкое окончание -ченко (а не -енко) указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на -к: Скорытка → Скорытчин сын → Скорытченко. Это типично для украинских фамилий: Гриценко (от Грицько), Ковальченко (от Ковалько).

В сословном плане носители фамилии, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству — именно в этих средах модель на -енко была особенно распространена в XVII–XVIII веках. Дворянских родов Скорытченко в Российской империи не зафиксировано.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Скорытин, Скорыткин и Скорытов — русские варианты, чаще встречающиеся в северных и центральных областях. Скорытченко же — чисто украинская форма, сохранившая суффикс сыновства.