Фамилия Скрученкова — женская форма, а её основа, мужская фамилия Скрученков, образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов. Этот суффикс в XIX веке закрепился за фамилиями, произошедшими от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. В данном случае корень — «скручен-», что сразу указывает на глагол «скрутить» и его причастие «скрученный».

Самая прямая версия происхождения — прозвище Скрученок, то есть «скрученный». В крестьянской среде так могли назвать человека с какой-то физической особенностью: сутулого, с искривлённой осанкой или скрюченной рукой. Прозвища по внешнему виду были обычным делом — так же появились Кривой, Горбатый, Косой. Другая версия, менее вероятная, отсылает к ремеслу. Скрученком могли называть того, кто занимался витьём верёвок, канатов или скручиванием нитей — в словарях русских говоров слово «скрутка» означает жгут или скрученную пряжу. Но если бы фамилия шла от ремесла, логичнее было бы ожидать основу «Веревкин» или «Канатов», а причастие «скрученный» проще привязать к человеку, чем к инструменту.

С географической точки зрения фамилия редкая, и её очаги, судя по данным современных переписей, тяготеют к центральным и южным областям России — Воронежской, Липецкой, Ростовской. В этих регионах распространены фамилии на -ов от причастий (например, Рванов, Ломанов), что косвенно подтверждает народное, а не книжное происхождение.

Интересно, что фамилия не имеет однозначного соответствия в церковных святцах — она не от крестильного имени, а от бытового прозвища. Это значит, что предок носителя фамилии был, скорее всего, крестьянином или посадским человеком, получившим фамилию при переписях XIX века, когда прозвище отца перешло детям. Вариант написания с «ё» (Скручёнков) встречается, но реже — в официальных документах XIX века «ё» часто заменяли на «е», поэтому путаница норм.

Правдоподобнее всего, что фамилия отражает внешнюю примету конкретного человека, а не род занятий. Никаких известных дворянских родов или исторических личностей под этой фамилией не зафиксировано — это «народная» фамилия, каких в России тысячи.