Фамилия Софищенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко в ту эпоху означал «сын» или «потомок», то есть Софищенко — буквально «сын Софища». А вот с самим именем Софищ интереснее: это неканоническая, народная форма от крестильного имени Софония (древнееврейское «Господь сокрыл»), которое в просторечии на украинских землях могли переделывать в Софий, Софищ, Софьон. Встречается и версия, что основа — София, но тогда ожидалась бы форма Софиенко, а не Софищенко: суффикс -ищ- в украинских фамилиях часто указывает на производное от имени с суффиксом -ищ- (например, Грищ от Григорий, Софищ от Софоний).

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины: Черкасской, Полтавской, Сумской. В документах XIX века Софищенко встречаются среди казацкого сословия и свободных крестьян, что типично для фамилий с этим суффиксом — они редко фиксировались у дворян, чаще у мещан и селян. Интересная деталь: в ряде метрических книг XVIII века форма записана как Софищенко, а в более поздних — Софищенко, что указывает на постепенную замену мягкого «щ» на твёрдое «щ» под влиянием русской орфографии.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Софиенко, Софийчук, Софонов — показывает, что Софищенко стоит особняком: у неё редкий суффикс -ищ- в основе, который обычно встречается в прозвищах от уменьшительных форм (Грищенко, Тищенко). Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был сыном человека по имени Софищ — просторечного, домашнего варианта, который в официальных документах не фиксировался. Споров о происхождении корня нет: все версии сходятся на библейском имени Софония, а не на греческом София.