Фамилия Сопубекова — одна из тех, где на стыке языков и культур рождается неожиданная история. В ней слышен восточный отзвук, а точнее — тюркский или кавказский след. Основа фамилии — мужское имя Сопубек, которое состоит из двух частей: «Сопу» и «бек».

Первая часть, «Сопу», — это искажённое или диалектное произношение арабского «суфи» (от «суф» — шерсть, грубая ткань). Суфиями на Востоке называли мусульманских мистиков, аскетов, странствующих дервишей. Со временем слово перешло в разряд личных имён: Сопу, Сопы, Сопубек — «бек-суфий», то есть «господин из рода суфиев» или «благородный аскет». Вторая часть, «бек», — титул знатности, князь, господин. Такие составные имена (Бексултан, Алибек, Сопубек) типичны для народов Средней Азии, Кавказа и Поволжья.

Фамилия образована по русской модели: к основе Сопубек добавили типичный для женской формы суффикс -ов- и окончание -а. То есть Сопубекова — это «дочь (или жена) Сопубека». Мужской вариант — Сопубеков. Эта модель — самая распространённая среди русских фамилий, но здесь она наложилась на нерусское имя, что говорит о времени возникновения: скорее всего, XIX — начало XX века, когда у народов Российской империи активно записывали фамилии по русскому образцу.

Географически фамилия тяготеет к северокавказским республикам (особенно Дагестан, Чечня, Ингушетия) и к Казахстану. Встречается и у киргизов. В русских переписях и базах данных Сопубекова — редкая фамилия, не входящая даже в первую тысячу. Это значит, что её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких родов, а не разбросаны по всей стране.

Споров вокруг этимологии почти нет: тюркское происхождение с арабским корнем очевидно. Единственный нюанс — не путать «Сопу» с русским словом «сопля» или «сопеть»: это случайное звуковое совпадение, не имеющее к фамилии никакого отношения. Предки носителей этой фамилии, вероятно, были людьми уважаемыми в своей общине — либо знатного происхождения (бек), либо духовного звания (суфий), либо и то и другое вместе.