Фамилия Союхтанова — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а географическое прозвище, причём с явным тюркским следом. Её разбор сразу выдаёт регион происхождения: корень «Союхт-» и характерный суффикс «-ан-» указывают на астраханские или кавказские степи, где веками смешивались ногайские, калмыцкие и татарские говоры.

Скорее всего, фамилия образована от топонима Союхта — так назывались аулы или урочища в низовьях Волги и на Северном Кавказе. В тюркских языках «сойух» (или «союх») значит «холодный», «студёный»: Союхта — «холодная речка» или «холодное место». Суффикс «-ан» в фамилиях этого ареала нередко указывал на принадлежность к местности: Союхтанов — «тот, кто из Союхты». Женская форма Союхтанова закрепилась за потомками по отцу.

Мужской вариант Союхтанов строится по продуктивной модели «топоним + -ов», но с редкой вставкой «-ан-», что сближает её с фамилиями типа Ахтанов или Койбагаров. Без этой вставки форма звучала бы как Союхтов — и такие записи действительно встречаются в метрических книгах Астраханской губернии конца XIX века. Однако вариант с «-ан-» победил, возможно, из-за аналогии с фамилиями на -анов, которые казались более «русскими» по звучанию.

Социальный статус первых носителей был невысок: по переписям начала XX века Союхтановы числились государственными крестьянами или казаками в станицах Черноярского уезда. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно, что подтверждает её простонародное, прозвищное происхождение.

Встречаются искажения написания — Союктанов, Саюхтанов — из-за неразличения «ю» и «у» в устной речи. Но правильная форма с «ю» сохраняет прямую связь с исходным тюркским словом, и её стоит считать исходной.