Фамилия Спонченко звучит редко и сразу обращает на себя внимание нехарактерным для восточнославянских фамилий корнем. Если отбросить типичный украинский суффикс -енко, указывающий на потомка («чей сын»), то остаётся основа «Спонч-». Она не связана ни с одним из распространённых славянских имён или названий профессий. Самое вероятное объяснение — фамилия образована от прозвища, данного по внешности, поведению или роду занятий.

В основе лежит слово «спонча», которое в южнорусских и украинских говорах имело несколько значений. Первое — «губка» или «мочалка», второе — «пористый, ноздреватый предмет», а также переносное «слабовольный, мягкий человек». Прозвище Спонча могли дать либо человеку с рыхлым телосложением, либо тому, кто торговал мочалками или выделывал губки. Встречается и диалектное слово «спончина» — «щепка, лучина», что могло относиться к мастеру по расщеплению древесины или к худому, «сухому» человеку.

Альтернативная, менее убедительная версия выводит фамилию от польского «sponka» — «пряжка, застёжка». В этом случае Спонченко — потомок портного или шорника, который делал пряжки. Однако географическое распространение фамилии (преимущественно на востоке Украины, в Сумской и Полтавской областях) говорит в пользу исконно славянского, а не заимствованного корня.

Словообразовательная модель здесь классическая для украинского антропонимикона: прозвище Спонча + патронимический суффикс -енко. Фамилия фиксируется в метрических книгах XIX века на территории Харьковской губернии, что подтверждает её крестьянское происхождение. Дворянской или казацкой старшиной Спонченко не были — это фамилия простого люда, скорее всего, ремесленников или крестьян, получивших прозвище по бытовой детали.

Поскольку фамилия редкая, у неё почти нет «однофамильцев» с другим суффиксом — Спончов или Спончин почти не встречаются. Это делает Спонченко уникальным маркером: если вы носите эту фамилию, ваши предки жили компактно, в одном-двух сёлах на Слобожанщине, и прозвище закрепилось именно в форме «чей сын».