Фамилия Станишаускас — яркий пример литовской модели образования фамилий, которая почти не встречается у русских, белорусов или украинцев. Её окончание -аускас (в оригинале -auskas) — типичный литовский суффикс, указывающий на происхождение от имени или прозвища. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Станишев или Станишевский, но литовский язык перекроил её по своим законам.

Основа фамилии — Станиша. Это краткая, уменьшительная форма от крестильного имени Станислав (из польского или западнорусского влияния). Имя Станислав означает «стань славным» (от «стан» и «слава»). В Литве, особенно в исторических регионах Жемайтия и Аукштайтия, такие формы на -иша были распространены: от полных имён отсекали концовку, добавляли суффикс -иш- (-iš-). Станиша — это «маленький Станислав» или просто ласковое обращение к человеку по имени Станислав.

Суффикс -аускас (-auskas) в литовской ономастике выполняет функцию, похожую на русский -ов/-ев или польский -ский: он указывает на принадлежность или происхождение. Буквально Станишаускас — «сын Станиши» или «потомок Станиши». В XIX веке, после отмены крепостного права в Российской империи, многие литовские крестьяне получили фамилии именно по такой схеме — от имени отца или деда, с добавлением -auskas.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Литве, особенно к центральным и северным районам — Каунасскому, Шяуляйскому или Паневежскому уездам. В России или Беларуси она встречается редко и, скорее всего, принадлежит потомкам литовцев, переселившихся в XIX–XX веках. По сословному происхождению носители Станишаускас чаще всего были крестьянами или мелкими шляхтичами, но точных данных о дворянстве этой фамилии нет.

Стоит заметить, что в литовском языке фамилия могла видоизменяться по родам: у мужчины окончание -ас, у замужней женщины — -ене (Станишаускене), у незамужней — -айте (Станишаускайте). В русской среде эти формы обычно не сохраняются, и фамилия остаётся неизменной. Если искать однокоренные аналоги, то в Польше встречается Станишевский, в Беларуси — Станишев, в России — Станишев, но все они восходят к тому же имени Станислав.