Фамилия Стомаченко звучит как типичная украинская, и её разбор это подтверждает. В основе лежит суффикс -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок». То есть Стомаченко — это буквально «сын Стомака». Такие фамилии массово закреплялись в XVI–XVII веках на землях Речи Посполитой и Гетманщины, особенно среди казачества и крестьянства.

Корень — Стомак. В украинском языке слово «стома́к» имеет два значения. Первое — диалектное название желудка (от греческого «стомахос»). Второе — прозвище человека с большим животом, обжоры или того, кто носил характерный «пузатый» предмет, например бурдюк. Скорее всего, прозвище Стомак дали по внешнему признаку: полному, грузному мужчине. Прямых указаний на ремесло или должность здесь нет — это бытовая, «внутренняя» характеристика.

Встречается вариант написания через «а» — Стомаченко, хотя в некоторых говорах могло быть и «Стомаченко» с ударением на второй слог. Фамилия распространена в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской и Полтавской областях. В России её носители — потомки переселенцев конца XIX — начала XX века, когда шло активное освоение Кубани и южных губерний.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Стома, Стомин, Стоматов — показывает, что все они восходят к тому же прозвищу, но различаются способом оформления. Стомаченко — самая типичная для украинской традиции, где суффикс -енко почти полностью вытеснил другие модели. Если бы предок был записан в русских переписных книгах, фамилия могла бы принять форму «Стомаков» или «Стомин», но сохранилась именно украинская огласовка.

Таким образом, Стомаченко — это фамилия-характеристика, образованная от прозвища, которое дали по заметной внешней черте. Никакой тайны или дворянского происхождения здесь нет: перед нами типичная казацкая или крестьянская фамилия с юга Украины, которая в неизменном виде дошла до наших дней.