Фамилия Сухнатов — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, нужно сначала присмотреться к основе «Сухнат». Скорее всего, это не полное имя, а прозвище или производная форма от крестильного имени.

Самая вероятная версия: Сухнат — это народная, обиходная форма имени Сергей. В русской традиции имена часто усекали и добавляли суффиксы: Сергей → Серёга, Сергун, Сергунька. В южных и западных говорах «г» могло переходить в «х», а «н» появляться для удобства произношения. Так Сергей мог превратиться в Сергуна, а затем — в Сухната. Подтверждение этой модели — фамилия Сергунов, которая встречается гораздо чаще и явно восходит к тому же корню. Суффикс -ат- в русских фамилиях нехарактерен для образования от прилагательных (как «сухой»), зато типичен для прозвищных форм личных имён (сравните: Козёл — Козловат, Холм — Холматов — здесь иной случай, но принцип «основа + -ат-» для обозначения носителя признака работает).

Менее правдоподобная, но возможная версия отталкивается от слова «сухой» в значении «худой, тощий» или «суровый, чёрствый человек». В этом случае прозвище «Сухнат» могло означать «суховатый» (с оттенком, который даёт суффикс -ат-). Однако фамилии на -атов от прилагательных встречаются реже, чем от имён, и обычно имеют более прозрачную мотивировку (например, Горбатов — от «горбатый»). Для фамилии Сухнатов связь с «сухим» неочевидна: слово «сухнат» не зафиксировано в словарях как самостоятельное прозвище.

Таким образом, с высокой долей вероятности предки носителей фамилии Сухнатов — это потомки человека, которого в быту звали Сухнатом, то есть Сергеем. Фамилия образована по типичной патронимической модели: «чей сын?» — Сухнатов, то есть сын Сухната. Суффикс -ов указывает на принадлежность к роду. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, где переход «г» в «х» (гэканье) был нормой, а усечение имён — обычной практикой.