Фамилия Сусаркина — женская форма фамилии Сусаркин, которая образована по типичной русской модели с суффиксом -ин. Это значит, что в основе лежит имя или прозвище, оканчивающееся на -а или -я: Сусарка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Сусарки» или «жена Сусарки». Такая модель была особенно распространена в северных и центральных губерниях России.

Самая вероятная основа — прозвище Сусарка. В русских говорах, особенно на северо-западе, «сусар» или «сусарка» — это диалектное название рыжей белки. Прозвище могли дать человеку за рыжий цвет волос, подвижность или, возможно, за занятие охотой на пушного зверя. В некоторых диалектах «сусар» также означало «лентяй» или «соня» (от глагола «сусарить» — медлить, мешкать). Однако связь с белкой выглядит более убедительной: такие прозвища по цвету волос или повадкам давали часто и охотно.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с личным именем Сусар. Это могла быть уменьшительная форма от редкого крестильного имени Сусанна (в просторечии Сусанка), либо от мужского имени Сосипатр (в народной форме Сус). Но прозвищное происхождение для фамилии Сусаркин типичнее: суффикс -к- в основе указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму, характерную именно для прозвищ.

Фамилия редкая. Встречается в основном в центральной России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её прозвищный, а не «именной» характер: в этих регионах диалектное слово «сусар» было в ходу. Сословной привязки у фамилии нет: Сусаркины могли быть и крестьянами, и мещанами. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается единично, что говорит о её локальном бытовании.