Фамилия Сушун — редкий случай, когда основа слова не поддаётся однозначному прочтению. В ней нет привычного славянского корня, который легко связать с занятием или внешностью. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища, которое возникло из диалектного или заимствованного слова.

Самая прямая версия отсылает к глаголу «сушить» или прилагательному «сушеный». В русских говорах «сушун» могли назвать очень худого, сухопарого человека — того, кого «высушила» болезнь или возраст. В этом случае фамилия относится к группе «физических» прозвищ, как Костлявый или Сухой. Суффикс -ун в русском языке активен: он образует названия лиц по характерному действию или признаку (бегун, ворчун, толстун). «Сушун» логично вписывается в этот ряд: тот, кто сухой, или, реже, тот, кто сушит что-то (например, сено или рыбу).

Однако фамилия могла прийти и из другого языка. В тюркских языках есть корень «суш» со значениями «вода» или «пить», но он редко встречается в антропонимике. Более вероятна связь с калмыцким или монгольским «суш» — «сорока». Прозвище Сушун могли дать болтливому или пёстро одетому человеку. Такие «птичьи» фамилии встречаются у народов Поволжья и Приуралья, где русские контактировали с кочевыми культурами.

География фамилии подсказывает, что её носители сосредоточены на юге России и в Сибири, особенно в Краснодарском крае, Ростовской области и на Алтае. Это регионы активного смешения русского и тюркского населения, что укрепляет версию о заимствованном прозвище. В центральных областях России фамилия почти не встречается.

Словообразовательная модель проста: основа Сушун плюс нулевой суффикс (типично для прозвищ, перешедших в фамилию без изменений). Окончание -ов или -ин не добавлялось, что говорит о сравнительно поздней фиксации фамилии — скорее всего, в XIX веке, когда прозвища уже не переоформляли в патронимы. Если бы фамилия была древней, она бы звучала как Сушунов. Но в реальности вариант Сушун встречается чаще, чем Сушунов.

Другие версии — от имени Суш (редкое сокращение от Сусанна или Сулейман) — выглядят натяжкой: суффикс -ун не характерен для русских уменьшительных имён. Поэтому основным остаётся прозвищное происхождение, а выбор между «сухим человеком» и «сорокой» — вопрос региональной принадлежности конкретного рода.