Фамилия Сюкупузов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с тюркским языком, а не с русским. В ней отчётливо слышится основа «сюкюп» или «сюкюпю», которую можно вывести из тюркского глагола со значением «целовать» или «обнимать». В сочетании с суффиксом -уз (тюркский аффикс принадлежности, часто встречающийся в именах и прозвищах) слово могло означать «целующий» или «обнимающий». Это не ремесло и не имя отца, а характеристика человека — ласкового, любящего обниматься, или, напротив, назойливого, прилипчивого. В русских говорах такого корня нет, поэтому версия о тюркском происхождении — основная и самая правдоподобная.

Фамилия оформлена по русской модели с суффиксом -ов, что типично для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я: Сюкупуз → Сюкупузов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Сюкупуза». Если бы фамилия закрепилась в более ранний период, она могла бы звучать как Сюкупузин (по аналогии с Репин, Пушкин), но -ов стал доминирующим патронимическим суффиксом в XVI–XVII веках, особенно для фамилий, не имевших окончания на согласный в основе.

Географически фамилия, скорее всего, возникла в регионах активного русско-тюркского контакта: Поволжье, Приуралье, южные степи. Носители могли быть выходцами из служилых татар, башкир или чувашей, которые переходили на русскую службу и получали фамилии по прозвищам. Сословно это, вероятно, были не крестьяне (у них фамилии закрепились позже и проще), а либо однодворцы, либо мелкие помещики, либо казаки — группы, где прозвища фиксировались раньше и могли сохранять тюркские корни.

Сравнение с однокоренными фамилиями вроде Сюкуров, Сюкюров или Сюпкаев показывает, что корень «сюк-» в русских фамилиях почти всегда восходит к тюркским основам, связанным с действием или качеством, а не с предметом. Это отличает Сюкупузова от, скажем, Тюльпановых (от названия цветка) или Кукушкиных (от птицы) — здесь основа глагольная, а не именная.

Спорных версий немного: кто-то может попытаться вывести фамилию от русского диалектного «сюкуня» (нечто согнутое, скрюченное) или от названия растения, но это натяжки. Тюркская этимология объясняет и форму, и смысл без лишних допущений. В документах фамилия почти не встречается — это редкий ономастический артефакт, сохранившийся, возможно, в единственном роду.