Фамилия Тафтонова — редкий пример, где основа, скорее всего, не русская, а заимствованная, но оформленная по русской модели. Суффикс -ов указывает на типичную патронимическую (по отцу) или посессивную (по владельцу) форму: Тафтонов — «чей?» — потомок или человек из семьи Тафтона. Женский вариант Тафтонова — это форма жены или дочери Тафтонова.

Ключевой вопрос — что такое «Тафтон». В русском языке такого слова нет, и это главная зацепка. Скорее всего, в основе лежит иноязычное прозвище или фамилия, которая попала в русскую среду и обросла типичным окончанием. Самый вероятный источник — английская фамилия Tafton или Taunton. Английская фамилия Taunton, в свою очередь, происходит от названия города в Сомерсете (Taunton). В этом случае предок носителя мог быть выходцем из Англии, либо получить прозвище «Тафтон» за связь с этим местом (например, торговал с англичанами или служил у иностранца).

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — искусственное происхождение. В семинарской среде, где будущим священникам давали «благозвучные» фамилии, могли переделать греческое слово (например, от ταφή — «погребение» или ταφών — «погребальный»). Однако это очень редкий ход для русской церковной ономастики, где предпочитали латинские и греческие корни с положительным смыслом.

Третья, самая слабая гипотеза — от тюркского «тафт» (шелковая ткань, тафта). Но тогда фамилия выглядела бы как Тафтов или Тафтин, а суффикс -онов здесь нехарактерен. Тафтонова — это не «тафтяной», а именно «тафтоновский».

Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных регионах России и Поволжье, что косвенно подтверждает версию о единичном заимствовании — например, через обрусевшего иностранца или крепостного, получившего фамилию от помещика с нерусскими корнями. Сословно, скорее всего, это были крестьяне или мещане, так как дворянские фамилии с таким редким корнем не фиксируются.