Фамилия Тимуджчин — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели, образованные от крестильных имён, прозвищ или профессий. Её основа — монгольское имя Тэмуджин (в русской передаче — Тимуджин, Темучжин), которое носил при рождении Чингисхан. Суффикс -ин, характерный для русских фамилий, здесь не столько притяжательный (как в «Иванов» или «Сидоров»), сколько оформительский: он русифицирует иноязычную основу, делая её похожей на фамилии вроде «Кутузов» или «Годунов», где суффикс -ов/-ин присоединялся к тюркским именам.

Вероятнее всего, фамилия Тимуджчин — не прямая наследственная, а поздняя, искусственная. Её могли дать в духовном или казачьем сословии, где семинаристы или казаки получали фамилии по историческим или библейским именам. В XIX веке в среде калмыцких и бурятских казаков нередко встречались фамилии, связанные с монгольской историей — например, Чингисов, Батуев. Тимуджчин могла возникнуть как прозвище человека, которому приписывали властный или воинственный нрав, либо как «кабинетная» фамилия, придуманная при переписи.

Словообразовательная модель проста: корень «Тимуджч-» (от Тэмуджин) плюс типичный русский фамильный суффикс -ин. Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Тимуджчи́н, хотя в бытовой речи возможны колебания. География фамилии крайне узкая: по данным современных баз, единичные носители встречаются в Калмыкии и на юге России, что подтверждает связь с регионами, где исторически жили калмыки или астраханские казаки.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Темучжин, Тимуджин) показывает, что вариант с «ч» — результат оглушения или диалектного произношения, а не ошибка переписчика. В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова эта фамилия не фиксируется, что говорит о её малой распространённости и позднем происхождении. Искать в ней древнюю родословную не стоит: скорее всего, она возникла в XIX–XX веках как дань памяти великому завоевателю.