Фамилия Токтобаев — тюркская по происхождению, и её разбор стоит начать не с корня, а с географии. Она типична для народов, говорящих на киргизском и казахском языках, реже встречается у башкир и татар. В русской записи она закрепилась с типичным для фамилий аристократии и крестьянства суффиксом -ев, который в тюркских языках часто присоединяется к именам, оканчивающимся на согласный или мягкий знак.

Основа фамилии — мужское личное имя Токтобай. Оно составное: первая часть «токто» восходит к глаголу со значением «остановись», «стой», «будь устойчивым» или «задерживайся» (в смысле «оставайся жить», «не умирай»). Вторая часть «бай» — древний тюркский титул, означающий «господин», «богач», «хозяин». В доисламские времена и после принятия ислама «бай» часто добавляли к именам как пожелание богатства и статуса. Таким образом, Токтобай — имя-оберег: родители давали его ребёнку, чтобы тот «остановил» смерть или болезни, то есть выжил и стал крепким хозяином.

Словообразовательная модель здесь простая: имя Токтобай + русский патронимический суффикс -ев, который в XIX–XX веках массово добавлялся к тюркским именам при русификации документов. В оригинале, без русского окончания, фамилия звучала бы как Токтобай или Токтобайулы (у казахов) / Токтобаев (у киргизов в адаптированной форме). Важный нюанс: в киргизском языке ударение падает на последний слог, а в русском произношении — на второй (Токтóбаев), что нередко приводит к путанице при записи.

В ономастических справочниках по тюркским фамилиям (например, в работах А. Суперанской) подобные имена на «токто-» классифицируются как охранительные. Родители нередко называли сына Токтобаем, если в семье умирали предыдущие дети, — верили, что имя «задержит» новорождённого в этом мире. Прямых аналогов в славянских языках нет, но по смыслу это близко к русскому имени Ненаш или поздним советским именам-лозунгам.

Социальный статус первых носителей фамилии определить сложно: «бай» в имени указывает скорее на пожелание, чем на реальное богатство. Среди Токтобаевых встречались и скотоводы, и ремесленники, и воины. В советское время фамилия распространилась в среде интеллигенции — встречается среди учителей, врачей и инженеров в Кыргызстане и Казахстане.

В написании возможны варианты: Токтобаев (основной), реже Токтобайев или Токтобай (без суффикса). В дореволюционных метрических книгах иногда фиксировали как Токтобаевъ с твёрдым знаком. Если вы встретили фамилию Токтобаев у человека не из Средней Азии, скорее всего, это потомок переселенцев или результат смешанных браков.