Фамилия Токтыманова — редкий случай, когда основа почти наверняка тюркская, а суффикс — русский, стандартный для фамилий женского рода. Это женская форма от Токтыманов, а мужская образована по модели «русская фамилия = тюркское имя + -ов».

Корень здесь — личное имя Токтыман. В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, «токта» или «тукта» означает «стой», «остановись». Глагольная форма «токты» — «остановился», «устоял». Имя Токтыман, скорее всего, составное: первая часть от «токта» (стой), вторая — уменьшительно-ласкательный или усилительный аффикс «-ман». Буквально имя могло означать «Упорный», «Стойкий», «Тот, кто устоял». В дохристианской ономастике у тюркских народов такие имена давали детям, чтобы защитить их от сглаза или болезней, — как оберег: «остановись, беда, не тронь этого ребёнка».

Фамилия Токтыманов, а значит и Токтыманова, географически привязана к регионам расселения татар, башкир и других тюркоязычных народов Поволжья и Урала. Встречается она и в Сибири, куда переселенцы принесли её в XVIII–XIX веках. Важная деталь: фамилия не дворянская и не княжеская. Она относится к так называемым «народным» фамилиям, которые фиксировались у крестьян и мещан во время массовых переписей — ревизских сказок. Носитель фамилии Токтыманов — потомок человека, чьё личное имя Токтыман стало родовым прозвищем, а затем, после введения обязательных фамилий в России (особенно активно в XIX веке), закрепилось за его детьми и внуками.

В русском языке фамилия сохранила тюркскую основу, но получила типично русский суффикс принадлежности. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Токты́манова, хотя в разных семьях возможны варианты. С точки зрения словообразования, это типичная «патронимическая» фамилия: отвечает на вопрос «чей?» — «сын Токтымана». Никаких сложных морфологических редкостей в ней нет, но сама основа делает её заметной среди фамилий славянского корня.