Фамилия Толныкина — женская форма фамилии Толныкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Толныка. Это редкая фамилия, которая почти не встречается в центральных регионах России, а её география тяготеет к южным и юго-восточным областям, в частности к Ростовской области и Краснодарскому краю. Такая локализация — важная подсказка: фамилия сформировалась в среде донского и кубанского казачества или среди переселенцев из южнорусских губерний.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Толныкина — дочь или жена Толныки. Сама основа «Толнык» — скорее всего, прозвище, образованное от глагола «толнуть» (ударить, толкнуть) или от существительного «толн» (удар, толчок). В южнорусских говорах «толныкать» означало «стучать, колотить», а «толныка» — человека, который постоянно чем-то стучит, суетится или, наоборот, работает с грубой силой (например, кузнец, плотник). Вполне вероятно, что первый носитель фамилии получил её за шумную, беспокойную натуру или за профессию, связанную с ударами и грохотом.

Есть и вторая, менее очевидная версия: связь с диалектным словом «толнык» в значении «толстый, неуклюжий человек». В некоторых говорах «толныка» — это не просто удар, а тяжелый, грузный предмет или человек. Если это так, то прозвище носило описательный, внешний характер. Однако первая версия — профессиональная или поведенческая — выглядит убедительнее, потому что прозвища по действию (грохот, стук) в казачьей среде были распространены шире, чем прозвища по внешности.

В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского и в словаре русских фамилий Б. Унбегауна прямого упоминания фамилии Толныкин нет, что подтверждает её локальный, нестоличный характер. Однокоренных фамилий в общерусском списке тоже мало — можно вспомнить разве что Толнов или Толначёв, но они образованы от других основ. Таким образом, Толныкина — это фамилия-отчество от прозвища, за которым стоит конкретный человек, вероятно, работавший с молотом, стучавший по наковальне или просто отличавшийся шумным нравом.