Фамилия Троеперстов — одна из тех, что построена на числительном. В её основе лежит сочетание «три» и «перст» (палец). Прозвище Троеперст или Троеперстов могли дать человеку с физической особенностью — например, с тремя пальцами на руке вместо обычных пяти, либо с травмой, после которой осталось три пальца. В русской ономастике такие прозвища по числу пальцев, зубов или других частей тела — явление известное, хоть и не массовое. Прямых параллелей с фамилиями вроде Шестипалов или Кривоногов здесь достаточно, чтобы считать эту версию основной.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: прозвище Троеперст плюс суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Троеперста). Окончание -ов здесь закономерно, так как прозвище заканчивалось на твёрдый согласный. Встречается также вариант Троеперстов, где на письме сохранилось стечение согласных, нередкое в старых документах, — это не ошибка, а отражение произношения в эпоху до закрепления норм орфографии.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных переписях и метрических книгах она фиксируется в основном в центральных губерниях России — Московской, Рязанской, Тверской. Встречается и у старообрядцев, что неудивительно: прозвища по физическим приметам были распространены в среде, где прозвище могло закрепиться как родовое имя без связи с официальным крестильным именем.

Спорных версий немного. Иногда фамилию пытаются связать с церковным жестом троеперстия (сложение трёх пальцев для крестного знамения), но это маловероятно. Во-первых, троеперстие — обрядовая деталь, а не личная характеристика. Во-вторых, в русских говорах слово «троеперст» в значении «сложивший три пальца» не зафиксировано как прозвище. Гораздо логичнее, что прозвище дали по внешнему признаку, а не по богослужебной практике.

Среди однокоренных фамилий — Троеперстов, Троеперстнев, Троепёрстов (с буквой ё, что указывает на ударение на второй слог). Все они восходят к той же основе, и различия в написании объясняются местными говорами и неграмотностью писарей. Единого «правильного» варианта нет: в документах XIX века одна и та же семья могла записываться по-разному.

Социальный контекст: носители фамилии в основном крестьяне и мещане. В дворянских родословных книгах Троеперстовы не значатся — фамилия явно низового происхождения, что подтверждается её прозрачной «характеристической» природой. Такие фамилии редко давали по заслугам или по роду занятий, чаще по случайной, но запоминающейся черте человека.