В основе фамилии Трофуша лежит мужское имя Трофим, точнее его искаженный просторечный вариант Трофуша. Само имя Трофим имеет греческое происхождения и переводится как “кормилец”. В результате, потомки человека, обладающего именем Трофуша, со временем получили фамилию Трофуша.