Фамилия Трофуша — редкий пример того, как фамилия совпала с прозвищем, от которого произошла. Её основа — мужское имя Трофим, точнее его просторечная, искажённая форма Трофуша. Так в быту могли звать человека по имени Трофим, и это уменьшительное обращение со временем закрепилось за его потомками как фамильное прозвание.

Само имя Трофим пришло на Русь из греческого языка и переводится как «кормилец», «питающий». Это имя было распространено среди крестьян и мещан, поэтому фамилии, образованные от его разговорных вариантов, встречаются в разных регионах. Однако форма Трофуша — не самая частая. Гораздо чаще встречаются фамилии Трофимов, Трофимчук, Трохин. Трофуша выделяется на их фоне: она сохранила не просто уменьшительный суффикс, а целую народную форму имени, которая почти исчезла из живого употребления.

Словообразовательная модель здесь простая и древняя. Если бы фамилию создавали по стандартному правилу, от имени Трофуша образовали бы Трофушин (по модели «чей?» — «сын Трофуши»). Но фамилия Трофуша осталась в начальной форме, без суффикса принадлежности. Такой тип характерен для украинских и белорусских фамилий, где прозвище часто переходило в фамилию без изменений. В русской среде это встречается реже и обычно указывает на давнее происхождение, когда фамилия ещё не оформилась окончательно и существовала как уличное прозвание.

Вероятно, предок носителя этой фамилии был заметным человеком в своей общине: его звали Трофимом, но окружающие — соседи, односельчане, а позже и чиновники при переписи — записали его просторечным именем Трофуша. Потомки унаследовали это прозвание, и оно закрепилось за ними уже как наследственная фамилия.

Отдельного внимания заслуживает звучание: Трофуша — мягкое, почти ласкательное. Такие формы чаще давали не официально, а в быту, и они отражают тёплое отношение к человеку. Поэтому фамилия несёт в себе отпечаток народной речевой культуры, где полное имя Трофим звучало слишком торжественно, а Трофуша было своим, домашним.

Сегодня фамилия Трофуша встречается нечасто, и это делает её особенно ценной для генеалогии: она не растворилась в массе однотипных Трофимовых, а сохранила уникальный след того, как имя жило в народной среде.