Фамилия Цэдилен — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. В русском языке суффикс -ен в фамилиях встречается нечасто: он характерен для украинской и польской традиции (вспомните хотя бы фамилии Коваленко, Ткаченко, где -енк- — уменьшительный суффикс). Но здесь мы видим не -енко, а просто -ен, что наводит на мысль о немецком или еврейском влиянии, точнее — о переселенческом следе.

Скорее всего, основа фамилии — топоним Цэдилен (или Цедилен). Такое название носили несколько населённых пунктов в Восточной Пруссии (ныне территория Калининградской области и Польши). Например, деревня Zedilien (современный посёлок Широкое в Калининградской области) или Zedlitz. Немецкие фамилии, образованные от названий мест, часто получали окончание -en (как вариант -er), указывающее на происхождение: «тот, кто из Цэдилена». В таком случае носитель фамилии — потомок переселенца, который в XVIII–XIX веках перебрался из Пруссии в центральные губернии России или на Волынь.

Менее вероятна, но не исключена версия от личного имени. В идише или немецком языке могло существовать прозвище Zedel (от идиш «цедл» — «маленький», или от немецкого Zettel — «записка», «листок»). Тогда суффикс -ен давал бы значение «сын Цеделя» или «принадлежащий Цеделю». Однако такая модель нехарактерна для ашкеназских фамилий: у евреев чаще использовали суффиксы -ович, -зон или просто -с.

Правописание фамилии с буквой э после ц (Цэдилен, а не Цедилен) — дополнительный аргумент в пользу немецкого корня. В русской передаче немецкое Z часто даёт твёрдое ц, а e под ударением может переходить в э, чтобы сохранить произношение (сравните: Цэ, а не Це). В паспортах и документах такое написание встречается редко, что делает фамилию Цэдилен уникальной даже среди однокоренных.

Итак, с высокой долей уверенности: фамилия Цэдилен — топонимическая, указывает на предка, который жил или родился в прусском местечке Цэдилен (Цедилен). Носители такой фамилии, скорее всего, потомки немецких колонистов или обрусевших немцев, которые сохранили память о своей малой родине в фамилии.