Фамилия Ционковский — редкий случай, когда географическая основа почти не вызывает споров, а вот путь её появления в русском языке требует оговорок. Это типичная фамилия на -ский, образованная от названия места. В польской и западнорусской традиции суффикс -ский указывал на дворянское происхождение или на связь с владельческим селом, но к XIX веку такие фамилии могли получить и мещане, и духовенство.

Корень фамилии — топоним Ционково или Ционковице. Такие названия встречаются в Польше и на территории бывшей Речи Посполитой (современные Западная Украина и Беларусь). Вероятнее всего, в основе лежит имя Ционек — уменьшительная форма от католического имени Циприан (Киприан) или, реже, от польского слова cichy — «тихий». Вторая версия: название могло произойти от слова сюн (санскритское влияние через еврейское цён — «овца»), но это маловероятно для восточноевропейской ономастики.

Обратим внимание на написание: Ционковский, а не Цианковский или Цыонковский. Вариант с «ио» — след польской орфографии, где сочетание io читается как «ё» или «йо». В русской передаче буква «и» осталась как указание на мягкость предшествующего согласного. Это отличает фамилию от более частого Циолковский — та происходит от деревни Циолково и имеет иную огласовку.

Сословная принадлежность первых носителей — скорее всего, мелкая шляхта или однодворцы. На территориях, где фамилии на -ский носили в основном дворяне, Ционковские могли быть обедневшими землевладельцами, потерявшими имение после разделов Польши. В метрических книгах XIX века такие фамилии встречаются у католического духовенства и городских ремесленников, что подтверждает постепенное стирание сословных границ.

Если искать родственную фамилию по словообразованию, то ближе всего — Ционкевич (с патронимическим суффиксом -евич). А Ционковский — это именно «выходец из Ционкова» или «владелец Ционкова». Сегодня фамилия остаётся редкой, встречается в основном в западных областях России, Беларуси и среди потомков эмигрантов первой волны.