Фамилия Туктубаева — женская форма фамилии Туктубаев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, который гораздо чаще встречается в документах и справочниках. Основа фамилии — тюркское личное имя Туктубай. Оно составное: первая часть «тукту» восходит к тюркскому глаголу со значением «остановись», «стой» или «держись» (в повелительном наклонении), а вторая — «бай» означает «богач», «господин», «хозяин». В целом имя можно перевести как «будь богатым и стойким» или «остановись, богач» — в зависимости от интонации имени-пожелания, которое давали ребёнку, чтобы он был крепким, состоятельным и не знал бед.

Модель образования типична для тюркских фамилий, адаптированных русской грамматикой. К основе Туктубай добавили русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягких и шипящих основ, но здесь — после «й», который в русском языке часто переходит в «ев»). Получился Туктубаев — «сын Туктубая». Женская форма Туктубаева — грамматическое согласование по роду, никакого дополнительного смысла она не несёт.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили тюркские народы: Татарстан, Башкортостан, Казахстан, отчасти Оренбургская и Челябинская области. Встречается она нечасто, что говорит о локальном распространении родового имени. Судя по типу окончания (-ев, а не -ин или -ский), фамилия сложилась в крестьянской или мещанской среде, а не в дворянской, где предпочитали модели на -ский/-цкий.

Спорных версий у этой фамилии почти нет — прозрачная тюркская этимология и ясная словообразовательная цепочка не оставляют места для натяжек. Единственный нюанс: в некоторых диалектах «тукту» может означать не только «стой», но и «сытый», «довольный», что лишь усиливает пожелательный смысл имени-основы. Так что предки носителей фамилии Туктубаева — человек по имени Туктубай и его потомки, жившие, скорее всего, в приуральских или поволжских степях.