Фамилия Убботина — редкий пример, где необычное звучание почти наверняка указывает на нерусское происхождение основы. В ней нет привычных славянских корней, связанных с ремеслом или внешностью. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от имени или прозвища, которое пришло в русскую среду через контакты с финно-угорскими народами.

Основа «Уббот» — это адаптация карельского или вепсского имени Уббот (Убот), которое, в свою очередь, восходит к христианскому имени Иов (в народной форме Иовот). В карельском языке звук «и» часто переходил в «у», а конечное «т» — типичный финно-угорский суффикс. Таким образом, Убботин — это «сын Уббота», то есть потомок человека, которого в документах XVII–XVIII веков могли записать как Уббота. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: чей? — Убботин.

Географически фамилия должна была закрепиться на северо-западе России — в бывшей Олонецкой губернии, на территории современной Карелии или в Архангельской области, где вепсское и карельское население активно контактировало с русскими. В метрических книгах XIX века можно встретить крестьян с этой фамилией в окрестностях Олонца и Петрозаводска. Двойное «б» в современном написании — скорее всего, результат поздней орфографической путаницы: в документах фамилию могли писать и с одним «б» (Уботин), и с двумя.

Версия о том, что основа происходит от слова «убогий» (бедный, нищий), маловероятна. Во-первых, от «убогий» образовалась бы фамилия Убогов или Убожин, а не Убботин. Во-вторых, прозвища с явно негативным значением редко становились основой для фамилий в северных регионах, где ценили более нейтральные или описательные именования. Так что предки носителей фамилии Убботина — скорее всего, крестьяне-карелы или вепсы, принявшие православие и получившие фамилию по имени своего предка, записанному в церковной книге.