Фамилия Убожков — один из тех редких случаев, когда корень слова напрямую указывает на малоприятное, но очень конкретное прозвище. В основе лежит прилагательное «убогий», которое в древнерусском языке имело два основных значения: «нищий, неимущий» и «калека, увечный». Прозвище Убогой, Убожка давали либо человеку, живущему в крайней бедности, либо тому, кто страдал физическим недостатком. В крестьянской среде такое прозвище не было оскорблением в современном смысле — скорее констатацией факта, социального или телесного положения.

Модель образования фамилии стандартна для русского севера и центральных областей: суффикс -ов- добавляется к основе, оканчивающейся на согласный. Получается Убожков — буквально «сын Убожка» (где Убожок — уменьшительная форма от Убогой). Интересно, что в этой фамилии произошло фонетическое смягчение: корень «убог» превратился в «убож» перед суффиксом, что типично для живой русской речи, но редко для письменной фиксации.

По данным переписей и ревизских сказок XIX века, носители фамилии Убожковы встречались преимущественно в Вологодской и Вятской губерниях — регионах, где долго сохранялся архаичный пласт лексики. В этих местах слово «убогий» ещё в XIX веке употреблялось в прямом, бытовом смысле, без церковно-славянского оттенка. Встречается также вариант написания Убожков с буквой «ж» вместо ожидаемого «г» — это не ошибка, а отражение северного говора, где «г» перед суффиксом переходило в «ж» (как в фамилиях Дорожкин, Серёжкин).

Среди однокоренных фамилий — Убогов, Убогин, Убоженко. Но Убожков стоит особняком: суффикс -к- в основе (Убожок) указывает, что прозвище было дано не взрослому мужчине, а, возможно, подростку или младшему члену семьи, которого так дразнили в детстве. Со временем прозвище закрепилось и перешло в фамилию, потеряв изначальный уменьшительный оттенок.