Фамилия Учунджю — редкий для России случай тюркской фамилии, сохранившей исходное числительное в чистом виде, без русских суффиксов. Она образована от турецкого (или шире — огузского) слова üçüncü — «третий». В тюркских языках порядковые числительные нередко становились личными именами и прозвищами, особенно в семьях, где детям давали имена по счёту: первый, второй, третий. Так «Учунджю» могло означать «третий сын» или «третий ребёнок», то есть прямо указывать на очерёдность рождения предка.

Важная деталь: фамилия не получила типичного для русской ономастики суффикса -ов или -ин. Это говорит о том, что она закрепилась в среде, где тюркский язык сохранял влияние, или же была записана в документах уже в сложившемся виде — например, у крымских татар, азербайджанцев или турок-месхетинцев. Встречается также вариант написания Учюнджю, что ближе к современной турецкой орфографии (üçüncü).

В России и странах бывшего СССР фамилия крайне малочисленна. Её носители, скорее всего, происходят из семей, переселившихся из Турции, Закавказья или Крыма. В отличие от множества фамилий, образованных от профессий или качеств, Учунджю прямо говорит о семейном порядке: предок был «третьим» — и это прозвище стало родовым именем.