Фамилия Уксукпаев — редкий случай, когда географическое происхождение угадывается почти сразу, а вот точное значение исходной основы — предмет споров. Носители фамилии, скорее всего, ведут род из тюркоязычных регионов, в первую очередь — из Башкортостана или Татарстана, где встречаются похожие фамилии и топонимы. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих) указывает на русскую модель оформления фамилии, но сама основа — явно не славянская.

Корень Уксук- (или Уксукпай) имеет несколько версий происхождения. Самая вероятная — связь с башкирским или татарским словом уксак (или өксөк) — «хромой», «прихрамывающий». В тюркской антропонимии прозвища, данные по физическому недостатку, были обычным делом: Хромой, Косой, Глухой. Со временем такое прозвище могло закрепиться за родом. Вторая версия — происхождение от имени Уксук, которое, в свою очередь, могло быть вариантом имени Аксук («белая кость»? «белый сук»?) — но это уже область догадок, так как письменных фиксаций такого имени в доступных источниках нет.

Модель образования фамилии — от прозвища Уксук (или Уксукпай) с помощью патронимического суффикса -ев. Частица -пай в конце основы (Уксук-пай) — типичный тюркский компонент, означающий «господин», «богач», «владыка» (ср. Ахметпай, Ишпай). Таким образом, полное прозвище могло звучать как «Уксукпай» — «Хромой господин» или «Хромой богач». Это не противоречит логике: прозвище могло быть ироничным или описывать конкретного человека, который, несмотря на хромоту, был уважаемым или состоятельным.

Сословная принадлежность предков Уксукпаевых, скорее всего, не была дворянской. Фамилии на -ев от тюркских прозвищ чаще всего получали крестьяне, тептяри (сословие в Башкирии) или служилые люди из «инородцев». В дореволюционных переписях такая фамилия могла писаться по-разному: Уксукпаев, Уксюкпаев, Уксукбаев — из-за неустойчивости тюркских гласных в русской передаче. Встречаемость фамилии крайне низкая, что подтверждает её локальный, очаговый характер — вероятно, один род в нескольких поколениях.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Уксукпаев стоит в ряду с Уксуков, Уксуковский (если есть), и, возможно, с Аксуков (где корень ак- — «белый»). Но именно форма с -пай — редкий признак, который почти не оставляет сомнений в башкирском или татарском происхождении. Значение фамилии для современного носителя — не столько «хромота», сколько указание на конкретную местность и родство с человеком, которого в народе прозвали Хромым господином.