Фамилия Упчюс — редкий для русской ономастики случай. Она не вписывается в типичные модели образования русских фамилий на -ов, -ев или -ин, и с высокой вероятностью имеет иноязычное происхождение. Скорее всего, перед нами литовская фамилия: в литовском языке сочетание «чю» (čiu) встречается регулярно, а окончание -ус (-us) характерно для мужских фамилий в литовской грамматике. Таким образом, Упчюс — это литуанизированная форма, которую носитель получил при записи в документах Российской империи.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к литовскому слову «upė» — река. В таком случае Упчюс — это уменьшительно-ласкательная или патронимическая форма, означавшая «речной» или «сын того, кто живёт у реки». В литовской антропонимии фамилии, образованные от географических объектов, — обычное дело: например, Упялис (от upė) или Упенас. Вариант Упчюс мог возникнуть как производное от прозвища «Упис» (маленькая речка, ручей) с добавлением суффикса -юс, указывающего на принадлежность.

Вторая, менее вероятная версия — связь с глаголом «upti» (лит. — хрипеть, задыхаться). В этом случае прозвище Упчюс мог получить человек с хриплым голосом или одышкой. Однако такая трактовка встречается реже, так как фамилии от физических недостатков в Литве чаще образовывались по другим моделям.

В дореволюционных документах фамилия могла писаться по-разному: Упчюс, Упчус, а в польской традиции — Upczus. После присоединения литовских земель к Российской империи многие литовские фамилии русифицировали, но Упчюс сохранил исходное окончание, что говорит о том, что её носители жили в местности с сильным литовским влиянием — на территории современной Литвы или в приграничных районах Беларуси.

Сословно предки Упчюсов, скорее всего, были крестьянами или мелкими землевладельцами: в Литве фамилии на -ус редко встречались у дворян, чаще у свободных крестьян и однодворцев. Встретить эту фамилию в массовых списках переселенцев в Сибирь или на Дальний Восток почти невозможно — она осталась локальной.

Сегодня фамилия Упчюс — одна из тех, что почти не встречается за пределами Литвы и диаспоры. Если вы ищете её носителей, стоит обратить внимание на записи в метрических книгах католических приходов XIX века на территории Ковенской или Виленской губерний.